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籍方面也与马来人有很大分歧，所以，遭到了马来人的全面抵制，以致不得不于当年7月宣布将这一决定撤销。然而，这一政治经历却加速了马来民族主义与华人民族主义的发展，加速了马来亚政党政治加族群政治的进程，尤其奠定了影响至今的基本的政党结构，这就是三大族群政党的建立：代表马来族群的马来人国家统一组织（巫统：UMNO，成立于1946年5月）、代表华裔族群的马来亚华人公会（马华/MCA，成立于1949年）以及代表印裔族群的马来亚印度国民大会（MIC，成立于1946年）。
不过，另一方面，随后而来的独立斗争，却也奠定了马来亚及后来马来西亚的族群合作的基础和传统。1957年8月31日，马来亚正式宣布从英国殖民统治下获得独立（仍作为英联邦成员之一），就是包括三大族群在内的马来亚各族人民共同奋斗的结果，而以华人为主的抗英斗争所作的贡献是不能磨灭的。
二战期间，马来亚华人在马来亚**的率领下，本来曾与英国人一道反抗过日本侵略者，并为此做出了巨大的牺牲和贡献。但是，战后英国人主导的马来亚政治进程，却未能保障华人的基本权益，尤其把马来亚**排除在进程之外，结果迫使其继续拿起武器，进入热带丛林，开展抗英游击战争。英国殖民当局则宣布了全面的紧急状态（1948年6月16日宣布霹雳、柔佛为戒严区，17日宣布全部马来亚进入紧急状态，直到1960年7月31日始恢复正常状态），同时还执行了改变半岛居民居住结构的布里格计划（thePriggsPlan），即在半岛西部建立了大批的华人新村，以隔断华人与游击队之间的联系。
1963年9月16日，在联合了新加坡（后又退出）、砂拉越和北婆罗洲（沙巴）三地的基础上，马来亚联合邦进一步扩大为马来西亚联合邦。砂拉越本来属于文莱苏丹国。19世纪上半叶，处于衰退中的苏丹政权，发生内乱，英国冒险家JamesBrooke（詹姆斯·布鲁克）遂于1841年以协助平定内乱为名，趁机攫取了砂拉越州长一职，后来又以纳贡为条件，从苏丹手中获得了该州的全部主权，同时还不断侵夺苏丹的土地，以此开始了所谓布鲁克家族(whiterajahs)的统治，直到1946年。至于北婆罗洲，19世纪时，原是文莱苏丹国和苏禄苏丹国（位于今菲律宾南部）的争夺对象，但两王国均未真正统治过该地区。1865年，文莱苏丹擅自把它卖给了一位美国流亡冒险家，但是，最终却转到了一家英国公司(theDentBrothers)手中，该公司为获得该地的永久主权，分别于1877年、1878年与文莱和苏禄都签订了条约。1881年，该公司改组为新公司，名“英属北婆罗洲渣打公司”(theBritishNorthBor-neoCharteredCompany)，一直到1946年。实际上，早在1888年，英国就已将婆罗洲的这三地置为自己的保护领地，其目的是维持它们各自的现状，以消除领土纠纷。1946年后，砂拉越和北婆罗洲成为英国皇家直属殖民地，文莱则继续保留其保护领地身份。
马来西亚建国后，实行了议会民主制，同时，也像原来的宗主国英国一样，保留了马来国王作为国家主权象征。在迄今为止的政治实践中，巫统由于拥有占多数的马来族群这一选民基础，得以独霸马来西亚政坛，这样，除了国家元首(theYangdi-PertuanAgong)来自马来苏丹之外，内阁首相一职亦长期从代表马来族群的巫统中选任，再加上宪法对马来人特权的保障，以及维护和扩大土著利益的新经济政策的实施（20世纪70、80年代），确保国家意识形态统一的国家原则（RukunNegara/1971年8月31日宣布，其五大原则是：信奉上苍、忠于君国、维护宪法、尊崇法治、培养德行）的确立，还有以伊斯兰教为国教，以马来语为国语等，都充分奠定了马来族群在国内政治、经济、社会、文化等各方面的优越地位，当然，由于国家亦致力于维护国内各民族团结，尊重其他宗教信仰，非马来族群的各方面利益也得到了相当的实现，同时，社会的进步和国家的发展，也使各族群人民都分享到了应有的繁荣。1991年，前首相马哈迪宣布2020年让马来西亚进入发达国家的愿景，尽管目前看来其实现还面临着许多困难，但是，马来西亚在东南亚仍是一个有着极大发展潜力的国家这一点还是众所公认的。