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十岁那年，自己怀着梦想，初次参加联盟战就打进关东联盟石英大会16强；称霸橘子群岛联盟，获得橘子联盟荣誉训练家称号；再次挑战联盟打进成都地区白银大会8强；
十一岁那年，自己意气风发，带着皮卡丘从零开始，征战在芳缘联盟，称霸关东对战开拓区；
十二岁那年，自己壮志满怀，征战于神奥，活跃在伊修；
十三岁，自己信心十足，出发前往卡洛斯地区，在卡洛斯联盟拿到了自己自开始旅行以来最好的成绩——亚军！
……
3年半的时间过去了，自己挑战了这么多个地区的联盟，其中认识的不少训练家是修帝、翔太这样的新手，结果却在联盟战的时候作为强大的劲敌挡在自己的前方，自己的成长真的这么小吗？自己难道真的不适合成为一名小精灵训练家吗？
伸手拉下帽子遮住自己的脸，小智闭上眼睛，拼命忍住眼中的不甘，即使此刻只有他一个人在，他也不想将自己的不甘表现出来。
过了一会，小智忽然察觉到四周变得安静了，这种安静很诡异，连风声都无法听得见，连空气的流动都感觉不到，仿佛自己处在一个静止的空间内。
小智睁开眼睛坐起身，带好自己的帽子打量了一下四周，发现自己正飘在一个梦幻般的空间里面。这个空间到处都充满了灿烂的光团，这些光团不仅给人身体以温暖的感觉，还让人的内心有一种舒适的感受。
美中不足的是，这个充斥着温暖和光芒的空间内，不少暖色的光团中心浮现出点点的黑斑，散发着让人不舒服的感觉。
“这里是……什么地方？”
“这里是你的内心世界！”突然一个声音从小智的前方响起，随即一个身影慢慢的显现在小智的面前，熟悉的样子让小智脱口喊出对方的名字。
在小智被拉进自己的内心世界的时候，他的身体同时被一股强大的力量带离了大木博士的研究所后院。皮卡丘原本因为杰尼龟归队的消息而露出的笑容顿时僵在了脸上。
“皮卡皮！！”
小智和皮卡丘经过这么长时间的相处，最关键的是他们在每一个地区都会经历生死之难，经历和该地区的守护神的交道，这一切让他们之间形成了小智其他的精灵都只能羡慕的羁绊感应。不管是小智还是皮卡丘，他们平时都能模糊的感应到对方的存在。
可是现在，他突然感受不到小智的存在了。在他的感应中，他和小智之间那模糊的联系断掉了。
皮卡丘突然疯了一般跑起来，嘴里不断叫着“皮卡皮”，在研究院的后院四处奔跑，他现在唯一的线索，就是他跟小智最后的感应告诉他，小智就在前一刻，还在这个后院里。
大木博士、小建、君沙小姐不明白皮卡丘怎么突然就激动了起来，但小智其他的精灵听得懂，他们知道皮卡丘口中的“皮卡皮”是在叫小智，那是皮卡丘对小智的专属叫声。皮卡丘突然这么激动的叫着小智的名字，再加上他脸上焦急的神情，不用想，他们也知道肯定是小智出事了！
“到底发生了什么事？”君莎小姐看着小智的精灵突然四下散开，嘴里不断的喊着什么，不明所以的问着。
“‘皮卡皮’是皮卡丘在叫小智。小智他发生了什么事吗？”大木博士等人的身后，突然传来一个娇俏的女声问道。