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肺癌脑转移（brms）与显著的发病率和死亡率相关。传统的治疗模式侧重于获得局部控制，但生存效益有限。在过去的十年中，免疫系统已经成为癌症的一个强有力的预后和治疗靶点，使得免疫检查点抑制剂的发展。以程序性细胞死亡1（pd1）及程序性死亡配体1（pdl1）为靶点的药物已在多种癌症亚型中显示出效果。抗pd1药物pembrolizumab在治疗黑色素瘤和非小细胞肺癌（nsclc）相关的brm方面非常有效。在某些情况下，免疫治疗的持久反应改变了治疗nsclc的治疗模式。尽管这些免疫疗法的结果，仅在一小部分患者中显示出疗效，这就强调需要优化反应预测因子并确定新的治疗靶点。
随着以pdl1/pd1为靶点的药物获得成功，人们越来越关注替代性共抑制受体作为治疗靶点，如t细胞免疫球蛋白粘蛋白受体3（tim3）和淋巴细胞活化基因3（lag3）。这些受体的上调最初是在慢性病毒感染模型中观察到的，反映了t细胞在持续t细胞刺激下的活化和功能失调。这些“耗尽”的t细胞执行细胞毒性效应器的能力降低，从而导致免疫反应失调。
在肺肿瘤中，肿瘤浸润淋巴细胞（til）中免疫抑制受体的共表达也可以解释为持续抗肿瘤反应性的指标。我们团队的空间分辨和单细胞分析证明，在肺癌中共表达pd1lag3和tim3的til中，活化标记物的显著表达，支持它们可能仍然发挥抗肿瘤功能。因此，恢复效应功能和记忆状态对于增强抗肿瘤免疫具有重大意义。
系统发育基因组分析表明，brms相对于匹配的原发肿瘤具有明显的体细胞遗传学改变，支持中枢神经系统（cns）内疾病的生物学差异和选择性颅内靶向治疗的机会。
尽管免疫检查点抑制剂已成为中枢神经系统中具有活性的有效药物，但肿瘤免疫微环境的基本要素，包括brm中适应性免疫标记物的组成和功能特征，仍在很大程度上未被探索。在此，我们使用多重定量免疫荧光（qif）组织分析来评估肺癌相关brm和原发性肿瘤中主要til亚群的差异表达功能特征和临床意义。
我们还使用qif测量了pdl1，用于肿瘤和间质室的局部测量。与肿瘤区室相比，间质区室中pdl1表达显著降低（比例评分p0.023，qifp0.018），但区室之间存在较强的相关性。
在原发性肺肿瘤中，cd4+表达（r0.432）和cd8+表达（r0.418）与pdl1呈正相关（在线补充图1b）。在brms中未观察到这些相关性（在线补充图1c）。在原发性肺肿瘤和brm中，foxp3与pdl1的相关性相似（foxp3:r0.395在肺中，r0.256在brm中）。
通过t和qif测量，在原发性肺肿瘤和brm之间观察到类似的肿瘤pdl1表达（图1c和在线补充图2a和3a）。在配对样本子集中也发现了类似的趋势。
与原发性肺肿瘤相比，brms患者的til密度显著降低（p<0.0001；图2ab和在线补充图2和3），肺组织和脑组织微环境的对比。
选择性测定粒酶b作为cd3+t细胞中t细胞活化的标志物或ki67作为细胞增殖的标志物，显示brms中较低的t细胞gzb（p0.019）和类似的ki67水平。
使用qif同时测量cd3+t细胞上的免疫抑制受体（图3a），我们观察到brms中的pd1+（p0.013）tim3+（p0.021）和lag3+（p0.008）低于原发性肺肿瘤（图3b和在线补充图2，3）。
在原发性肺（r0.62–0.79）和brms（r0.64–0.80）中，cd3+t细胞中pd1tim3和lag3表达之间观察到了相对较高的相关性。
cd3+t细胞中tim3+（肺r0.568，脑r0.433）和lag3+（肺r0.549，脑r0.393）的表达与两种组织中的pdl1相关，尽管brms中的相关强度较低。
pdl1和pd1在肺肿瘤中相关（r0.405，p0.009），但在brms中不相关。
brms中高t细胞tim3+（对数秩检验，p0.041）和lag3+（对数秩检验，p0.035），而不是pd1+也与更长的生存期相关（图3c）。当在原发性肺肿瘤中测量时，根据个体免疫标记物的表达，未发现总生存率的差异（在线补充图6）。
在brms中，与其他组织学相比，具有神经内分泌特征的肿瘤具有更高的肿瘤细胞ki67和更低的tim3（在线补充表3）。诊断时iv期患者原发性肺肿瘤的tim3也显著高于早期患者。在组织取样之前接受过任何治疗的brm组织的c